Automation of DNA isolation from biological materials
Journal Title: Aparatura Badawcza i Dydaktycza - Year 2015, Vol 20, Issue 2
Abstract
The intensive development of biological sciences, both in the field of medicine and broadly defined biotechnology, created the need to improve the analytical techniques. Molecular biology methods based on the analysis of nucleic acids with high sensitivity and reproducibility deserve special attention. They facilitate precise identification of biological traces, assessing changes in gene expression profiles and complete evaluation of environmental niches biodiversity. The main factor determining effectiveness of analysis is a stage of genetic material isolation. There is a clear trend to increase the capacity and accuracy of DNA isolation. Currently it is possible to overcome the limitations associated with manual isolation techniques. Using of kits and automated robots facilitates working with hundreds of samples simultaneously. The aim of the study was to validate the selected genomic DNA isolation methods. Three commercial kits were used. Two of them, which are dedicated to the automatic platform BioRobot M48 Robotic Workstation (Qiagen), are based on the DNA adsorption on silica beads convenient handling of magnetic particles: QIAsymphony Investigator DNA Kit (Qiagen) and MagAttract® DNA Mini M48 (Qiagen). A third kit Sherlock AX (A&A Biotechnology) for manual isolation of genomic DNA are based on the mechanism of nucleic acin adsorption on ion exchange beads combined with the isopropanol precipitation of DNA. The determination limit, reproducibility and repeatability were evaluated. The results indicate that all of the analysed methods allow the isolation of high-quality genetic material, which can be used in subsequent molecular testing procedures.
Authors and Affiliations
Justyna Staninska, Zuzanna Szczepaniak, Agnieszka Piotrowska-Cyplik, Paweł Cyplik, Jakub Czarny
Keywords
Related Articles
- EP ID EP199209
- DOI -
- Views 99
- Downloads 0
Wpływ stężenia i formy boru na skład chemiczny strefy korzeniowej pomidora (Lycopersicon esculentum Mill.) uprawianego w wełnie mineralnej
Celem przeprowadzonych badań była ocena wpływu fertygacji borem na zmiany koncentracji składników w strefie korzeniowej, pod kątem zastosowania kwasu borowego w porównaniu z najczęściej używanym boraksem przy czterech po...
Związki (korelacje) między cechami mięsa nutrii
Celem niniejszych badań była charakterystyka podstawowych cech użytkowych mięsa nutrii i oszacowanie współczynników korelacji między nimi. Na 21 nutriach odmiany grenlandzkiej i standardowej oceniono organoleptycznie (w...
Analiza wpływu temperatury na przebieg procesu walcowania sworznia kulistego
W artykule przedstawiono analizę wpływu temperatury nagrzewania materiału wsadowego na otrzymywaną odkuwkę w procesie walcowania poprzeczno-klinowego. Efektem prac badawczych była analiza kształtu, dokładności wymiarowej...
Zastosowanie polipropylenowych membran mikrofiltracyjnych do otrzymywania emulsji
Celem pracy była ocena przydatności polipropylenowych membran mikrofiltracyjnych do wytworzenia emulsji typu O/W. Emulsję przygotowano z użyciem oleju rzepakowego (faza rozproszona) oraz wodne¬go roztworu sorbinianu poli...
Przegląd reaktorów wykorzystywanych do wytwarzania strącanego węglanu wapnia w procesie karbonatyzacji
Jednym ze sposobów produkcji na skalę przemysłową strącanego węglanu wapnia (PCC) jest karbonatyzacja, czyli proces wykorzystujący do reakcji gazowy dwutlenek węgla. Warunki hydrodynamiczne wytwarzane w reaktorze, w któr...