Fourier dönüşümü kızılötesi spektroskopisi ile CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin iki boyutlu ve üç boyutlu ortamdaki hücresel farklılıklarının belirlemesi

Journal Title: Dokuz Eylul Universitesi Tip Fakultesi Dergisi - Year 2019, Vol 33, Issue 1

Abstract

GİRİŞ ve AMAÇ: Sferoid kültürleri, hücrelerin kendi iç dinamikleri ve diğer hücrelerle olan etkileşimleri açısından tek tabakalı kültürlere kıyasla tümör dokusunun özelliklerini daha iyi yansıtmaktadır. Bu çalışmanın amacı, üç boyutlu (3D) ve iki boyutlu (2D) kültür ortamlarında üretilen CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin (KKH) makromoleküllerindeki benzerlik ve farklılıklarının araştırılmasıdır.YÖNTEM ve GEREÇLER: DU-145 prostat kanser hücre hattı içerisindeki CD133+/CD44+ yüzey belirteç özelliklerine sahip KKH’leri akış sitometrisi (FACS) kullanılarak izole edilmiştir. Agarla kaplı kültür kapları ile sferoid yapıları oluşturulmuştur. 2D ve 3D kültür ortamlarındaki KHK hücreleri Fourier dönüşümü kızılötesi (FTIR) spektroskopisi ile karşılaştırılmıştır. BULGULAR: CD133+/CD44+ hücrelerin birinci haftada agarlı kültür ortamlarında mikro-agregatlar oluşturduğu gözlenmiştir. İkinci haftada ise, olgun sferoid yapıların oluştuğu saptanmıştır. 2D ve 3D (multisellüler tümör sferoidleri) kültür ortamlarında üretilen hücreler ile yapılan FTIR analizleri KHK hücre yapısındaki proteinler, lipitler, karbonhidratlar ve nükleik asitlerde (DNA, RNA) önemli derecede farklanmalar olduğunu göstermiştir. Membran lipit açil zincir uzunluğu ve hücre zarı kalınlığı, proteinlerin sekonder yapıları ve DNA oligonükleotitlerin baz sekanslarında veya fonksiyonel gruplarında önemli farklanmaların olduğu tespit edilmiştir. Elde edilen sonuçlar, 3D kültür ortamında üretilen sfreoid yapılarının in vivo tümör dokusu ile benzer özellikler sergilediğini göstermiştir.TARTIŞMA ve SONUÇ: Hücre ortam koşulları ile yaratılmış olan fiziksel, kimyasal ve biyolojik özellikler hücrelerin kendi iç dinamiğini ve mikroçevresi içerisindeki etkileşimlerini önemli derecede etkilemektedir. 2D kültür ortamları ile hücreleri tek boyutta indirgemek hücrelerin gerçek özelliklerini yansıtmamaktadır. Bu nedenle, 3D kültür ortamları ile hücre dinamiklerinin incelenmesi gerekmektedir. Bu çalışmadan elde edilen sonuçlar, kanserde önemli bir hücre popülasyonunu oluşturan KKH’lerin membran yapısı, lipitler, proteinlerin sekonder yapıları ve DNA oligonükleotit yapılarının terapötik hedef olabileceğini göstermektedir.

Authors and Affiliations

Günnur Güler, Eda Açıkgöz, Gülperi Öktem

Keywords

Related Articles

ERKEN EVRE MİKOZİS FUNGOİDES’DE NÖTROFİL/LENFOSİT ORANI, TROMBOSİT/LENFOSİT ORANI VE ORTALAMA TROMBOSİT HACMİNİN PROGNOSTİK ÖNEMİ

Amaç: Mikozis Fungoides (MF), primer kutan T hücreli lenfomalar arasında en sık görülen lenfomadır. Erken evrelerde tanı alan birçok hastada prognoz oldukça iyi olmasına rağmen, bazı hastalarda hızla ileri evrelere geçiş...

Akut Myeloid Lösemi Hastalarımızın Retrospektif Değerlendirilmesi

Amaç: Akut Myeloid Lösemide (AML) konvansiyonel sitogenetik, FISH analizi ve moleküler genetik testler (Flt-3,NPM 1, inv 16 gibi) tedavi stratejisinde önem taşımaktadır. Çalışmamızda AML tanılı hastalarımızın sitogenetik...

The Effect of Li-Heparin Plasma Preference In Emergency Unit And New Emergency Test Request Panel On Troponin I Turnaround Time

INTRODUCTION: Serum to plasma sample type change and renewal of the emergency test request panel were carried out in our laboratory workflow to decrease the turnaround time (TAT) of the troponin I test requested from the...

Hiperkalsemi ve Patolojik Kemik Fraktürü İle Prezente Olan Bir İntravasküler B Hücreli Lenfoma Olgusu

Diffüz Büyük B Hücreli Lenfoma (DBBHL), sık görülen ve genellikle periferik lenfadenopati, hepatosplenomegali ve kemik iliği baskılanmasına bağlı bulgularla ve/veya ateş, gece terlemesi ve kilo kaybı gibi semptomlar ile...

Compassionate Use Programmes of Medicinal Products

Compassionate use programmes of medicinal products are intended to provide unauthorised medicines for humanitarian purposes without a fee for patients with a seriously or urgent and life threatening disease and who canno...

Download PDF file
  • EP ID EP532612
  • DOI 10.5505/deutfd.2019.44227
  • Views 86
  • Downloads 0

How To Cite

Günnur Güler, Eda Açıkgöz, Gülperi Öktem (2019). Fourier dönüşümü kızılötesi spektroskopisi ile CD133+/CD44+ prostat kanser kök hücrelerinin iki boyutlu ve üç boyutlu ortamdaki hücresel farklılıklarının belirlemesi. Dokuz Eylul Universitesi Tip Fakultesi Dergisi, 33(1), 45-56. https://europub.co.uk./articles/-A-532612