Identyfikacja profilu ekspresji genów związanego z opornością ex vivo na etopozyd w dziecięcych ostrych białaczkach
Journal Title: Advances in Hygiene and Experimental Medicine - Year 2012, Vol 66, Issue 0
Abstract
Wstęp: Oporność na terapię oraz związany z nią profil ekspresji genów dyskryminują wyniki leczenia, a także wskazują podgrupy pacjentów z niekorzystnym rokowaniem. Celem badań była analiza profilu ekspresji genów w korelacji z profilem chemiooporności ex vivo na etopozyd u dzieci z ostrymi białaczkami. Materiał/Metody: Profil oporności ex vivo oznaczono w teście cytotoksyczności MTT na komórkach białaczkowych pobranych od 56 pacjentów. Profil ekspresji genów opracowano na podstawie wyników hybrydyzacji cRNA do macierzy oligonukleotydowych HGU133A 2.0 Chip. Do zidentyfikowanego zestawu sond przeprowadzono analizę korelacji, grupowanie hierarchiczne, przypisanie lokalizacji i funkcji. Weryfikację danych o poziomie ekspresji dla 4 wybranych genów (MNDA, GH1, NUDT21, RHOG) przeprowadzono techniką QPCR w badanej oraz niezależnej grupie 54 pacjentów. Wyniki: Za pomocą permutacyjnego testu korelacji Spearmana wyselekcjonowano zestaw 233 sond/209 genów. Ekspozycja blastów białaczkowych na etopozyd inicjuje złożoną odpowiedź komórkową, będącą odzwierciedleniem globalnych zmian ekspresji genów. Globalny test istotności różnic potwierdził (p<0,001) związek profilu ekspresji genów z opornością na etopozyd. Gen NUDT21 (Nudix, nucleoside diphosphate linked moiety X-type, motif 21) wykazywał najsilniejszą korelację z opornością na etopozyd (FDR<0,0001%). Podsumowanie: Profilowanie ekspresji genów może pomóc w ocenie wrażliwości na leki stosowane w chemioterapii dużymi dawkami. Oporność na etopozyd prawdopodobnie jest związana ze znaczną liczbą biologicznie ważnych genów i jest konsekwencją współistnienia w komórce nowotworowej różnych mechanizmów.
Authors and Affiliations
Joanna Szczepanek, Jan Styczyński, Andrzej Tretyn, Monika Pogorzała, Mariusz Wysocki
Keywords
Related Articles
- EP ID EP66716
- DOI -
- Views 158
- Downloads 0
The participation of outer membrane proteins in the bacterial sensitivity to nanosilver
The presented study is to analyze the participation of outer membrane proteins of Gram- negative bacteria in sensitivity to silver nanomaterials. The mechanism of interaction of silver with the bacterial cell is best des...
Immunoregulacja poprzez interferencyjny RNA – mechanizmy, rola, perspektywy
Utrzymanie homeostazy organizmu zależne jest od prawidłowego funkcjonowania poszczególnych układów czynnościowych, co z kolei jest wynikiem sprawnej komunikacji pomiędzy elementami każdego z systemów, a nierzadko również...
Genetic and psychosocial factors for benzodiazepine addiction. An analysis based on the results of the authors’ own research conducted in a group of benzodiazepine addicted and non-addicted individuals
Purpose: In spite of the fact that the addictive potential of benzodiazepine (BDZ) drugs has been known for a long time, benzodiazepine addiction remains a common problem for psychiatry to deal with. The etiology of benz...
Komórki macierzyste raka płuca – udział w patogenezie i progresji nowotworu
Rak płuca zajmuje pierwsze miejsce wśród przyczyn zgonów na nowotwory złośliwe w Polsce i na świecie. W większości przypadków wysoki stopień zaawansowania choroby w chwili rozpoznania uniemożliwia wdrożenie leczenia przy...
Komórki macierzyste i progenitorowe w biostrukturze ścian naczyń krwionośnych
Rozwój układów naczyniowego i hematopoetycznego w czasie organogenezy odbywa się jednocześnie. Podczas waskulogenezy, część komórek nie podlega procesowi różnicowania się, a pozostaje na bardzo wczesnym etapie „zakotwicz...