IMPROVING THE OUTPUT OF SIGNALING PATHWAY IMPACT ANALYSIS
Journal Title: Revista Romana de Statistica - Year 2013, Vol 61, Issue 3
Abstract
Recently biologists want to find out the significant gene sets instead of individual gene. Many packages in different software mostly in R language were developed to find out the gene sets which are significantly regulated. Among them some packages are able to discover up and down regulation as well. Signaling pathway impact analysis (SPIA) is one of them. In this study an approach is mentioned which can be improved the output of SPIA. I proposed that using moderated t values gives more significant results instead of using logFC (log fold change) from Limma’s output in order to calculate probability of perturbation in SPIA
Authors and Affiliations
Mohammad Ohid ULLAH
Keywords
Related Articles
- EP ID EP120376
- DOI -
- Views 141
- Downloads 0
Model teoretic de analiză privind consumul din PIB
Analiza şi predicţia din consumul final reprezintă aspecte importante din punct de vedere macroeconomic. Rezultatele acestor abordări vor ajuta structurarea politicilor macroeconomice realiste. Cu scopul de a produce mod...
AN ASSESSMENT OF TOTAL FACTOR PRODUCTIVITY
The high performing East Asian development model sparked controversies in the academia: its success was ascribed alternatively to nation-states, markets, and sociocultural factors. This paper undertakes a comparative ass...
Relaţia dintre performanţele sistemului de învăţământ şi cerinţele pieţei muncii
Articolul prezintă rezultatele investigaţiilor cu unele neconcordanţe educaţionale apărute pe piaţa muncii din România şi soluţii pentru o adaptare mai rapidă a sistemului de învăţământ la transformările pieţei. Analiza...
Mathematical Structures in Italian Phonetic
In most work to date, investigating phonemes Italian has covered mostly qualitative aspect. In the following lines, we propose to address this idiom on the other I fonostructura coordinated - its quantitative side - mand...
Impactul economico – financiar al dării în plată
În acest articol, autorii analizează Legea/2016 privind darea în plată a proprietăţilor imobiliare în vederea stingerii obligaţiilor de credit. Se are în vedere contextul social care a condus la adoptarea legii, creditel...