Mycobacterium tuberculosis kompleksinin saptanmasında dokuz farklı nükleik asit amplifikasyon yönteminin tanısal değeri
Journal Title: Journal of Microbiology and Infectious Diseases - Year 2015, Vol 5, Issue 3
Abstract
Amaç: Bu çalışmada, yayma pozitif balgam örneklerinde ve yayma negatif balgam örneklerinde Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)’nin hızlı tanısında dokuz ticari Nükleik Asit Amplifikasyon Test sistemi (NAAT)’nin tanı performansı değerlendirildi. Yöntemler: Çalışma sırasında kullanılan 60 yayma pozitif ve 55 yayma negatif balgam örneği mikroskopik olarak Erlich Zielh Neelsen (EZN) boyama yöntemi ve Löwenstein Jensen (LJ) besiyerinde kültür ile değerlendirildi. Löwenstein-Jensen kültür yöntemi altın standart olarak kabul edilerek dokuz NAAT yönteminin duyarlılık ve özgüllükleri hesaplandı. Bulgular: Löwenstein Jensen kültür sonuçları altın standart olarak alındığında; Yayma pozitif örneklerde (COBAS Amplicor MTB (Metot A), GenProbe MTD (Metot B), Cobas TaqMan MTB PCR (Metot C), iCycler iQ RT-PCR (Metot D), TaqMan PCR AB 5700 (Metot E), TaqMan PCR AB7700 (Metot F), LightCycler® 480 RT PCR (Metot G), Rotor Gene RT PCR (Metot 104 Tarhan G, et al. Value of nine NAAT methods for Mycobacterium tuberculosis J Microbiol Infect Dis www.jmidonline.org Vol 5, No 3, September 2015 H) ve AdvanSure TB/NTM RT PCR (Metot I) yöntemlerinin duyarlılık oranı sırası ile % 98,3, % 93,3, % 96,7, % 100, % 93,3, % 100, % 100, % 100 ve % 100 olarak bulundu. Bu oran yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için %53,8; C ve H yöntemi için % 38,5; F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Dokuz NAAT metodu arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı. (p≥0.05). Yayma negatif balgam örneklerinde özgüllük bütün NAAT yöntemleri için % 100 olarak saptandı. Pozitif saptama oranı yayma negatif örneklerde A, B, D, E, G ve I yöntemleri için % 53,8, C ve H yöntemleri için % 38,5 ve F yöntemi için % 61,5 olarak bulundu. Bu oran yayma pozitif balgam örneklerinde D, F, G, H ve I yöntemleri için % 100; A yöntemi için % 98,3, C yöntemi için % 96,7, B ve E yöntemleri için % 93,3 olarak saptandı. Dokuz NAAT yöntemi arasında istatistiksel olarak anlamlı fark bulunmadı (p≥0.05). Sonuç: Dokuz NAAT yönteminin yayma pozitif örneklerde MTBK tanısında yararlı olabileceği, ancak yayma negatif örneklerde etkin olmadığı sonucuna varıldı. Anahtar kelimeler: Tüberküloz, polimeraz zincir reaksiyonu, nükleik asit amplifikasyon test, yayma pozitif, yayma negatif
Authors and Affiliations
Gülnur Tarhan, Salih Cesur, Hülya Şimşek, Ismail Ceyhan, Yusuf Ozay, Melike Atasever
Keywords
Related Articles
- EP ID EP127821
- DOI 10.5799/ahinjs.02.2015.03.0186
- Views 122
- Downloads 0
Fas’ta bir askeri hastanede artmış ithal sıtma sıklığı
Amaç: Meknes, Moulay İsmail Askeri Hastanesi’nde ithal sıtma olgularını değerlendirmek için, kayıtlı olguların epidemi yolojik, klinik, biyolojik ve gelişimsel özellikleri araştıran tanımlayıcı bir çalışma başlattık. Yö...
Streptococcus suis Meningitis in a French Cooker: Case Report and Review
Streptococcus suis is an emerging zoonotic pathogen, increasingly reported worldwide and especially in Asia. S. suis remains rare in France but is responsible for outbreaks in Asia, causing meningitis, septicemia, endoca...
Mycobacterium tuberculosis kompleksinin saptanmasında dokuz farklı nükleik asit amplifikasyon yönteminin tanısal değeri
Amaç: Bu çalışmada, yayma pozitif balgam örneklerinde ve yayma negatif balgam örneklerinde Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)’nin hızlı tanısında dokuz ticari Nükleik Asit Amplifikasyon Test sistemi (NAAT)’n...
Thyroid disorders associated with hepatitis C or interferon based therapies
Several extrahepatic diseases have been associated with chronic hepatitis C virus (HCV) infection (i.e. hematologic diseases, renal disease, dermatologic conditions). It has also been shown that HCV infection is associa...
Prognostic value of mean platelet volume and neutrophil to lymphocyte ratio in patients with Crimean-Congo Hemorrhagic Fever
Objective: Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) virus, a Nairovirus within the family Bunyaviridae, causes severe disease in humans. Pancytopenia, organ failures and disseminated intravascular coagulation may occur as...