ПРОФІЛЮВАННЯ ГЕНОМУ СОРТІВ ЧЕРЕШНІ УКРАЇНСЬКОЇ СЕЛЕКЦІЇ ЗА ДОПОМОГОЮ IRAP-ПЛР ТА REMAP-ПЛР МАРКЕРІВ
Journal Title: Naukovyi visnyk Chernivetskoho universytetu. Biolohiia (Biolohichni systemy) - Year 2014, Vol 6, Issue 2
Abstract
Використання однорідного садивного матеріалу з підтвердженою генетичною ідентичністю – одна з головних вимог при створенні садів інтенсивного типу. Ефективність методу ідентифікації та аналізу генетичних відмінностей між різними сортами плодових культур за допомогою традиційних фенотипових ознак є недостатньою, оскільки значним чином залежить від впливу факторів зовнішнього середовища. Профілювання геномів з використанням молекулярно-генетичних маркерів є найбільш точним та надійним способом вивчення генетичного різноманіття еукаріотичних геномів. Використання ретротранспозонних генетичних маркерів є потужним засобом для генетичного профілювання еукаріотичних геномів, оскільки вони є найбільш численною групою мобільних елементів в геномі рослин та відіграють важливу роль в його реорганізації у відповідь на дію природного та штучного добору. Проблема пошуку найбільш інформативних маркерних систем для генетичного профілювання геномів сортів черешні є особливо актуальною з огляду на досить низький рівень генетичного поліморфізму у цієї культури. Це є відображенням обмеженої генетичної мінливості геноплазми сортів черешні внаслідок системи гаметофітної самонесумісності. В роботі досліджено 13 сортів черешні української селекції та два сорти закордонної селекції в якості контролю. Загальну геномну ДНК виділяли ЦTAБ-методом з деякими модифікаціями. ПЛР проводили методами IRAP та REMAP. Продукти ампліфікації розділяли в поліакриламідному гелі. Дискримінаційні можливості використаних маркерних систем оцінювали за допомогою різних показників поліморфізму для порівняння їх інформативності. Проведена робота дозволила оцінити дискримінаційні можливості та технічні особливості застосування декількох систем генетичного профілювання геномів сортів черешні української селекції з використанням IRAP- та REMAP-ПЛР маркерів та виявити серед них найбільш перспективні для рутинного аналізування. Використання п'яти праймерів (IRAP-ПЛР) та двох комбінацій праймерів (REMAP-ПЛР) дозволило в сумі отримати 63 маркери, з яких 23.8 % виявилося поліморфними. Було показано, що для генетичного профілювання сортів черешні перспективним є застосування комбінації праймерів TRIM K002 +8565 й окремих праймерів TRIM K002, iPBS 2272 та iPBS 2077.
Authors and Affiliations
Я. І. ІВАНОВИЧ, Н. В. ТРЯПІЦИНА
Keywords
Related Articles
- EP ID EP246021
- DOI -
- Views 158
- Downloads 0
POSSIBILITY OF DESMODESMUS ARMATUS (CHOD.) HEGEW. CULTIVATION IN MIXOTROPHIC CONDITIONS
The study is devoted to investigation of the possibility of green microalga Desmodesmus armatus cultivation in mixotrophic conditions. Microalgae were cultivated on the waste water from RAS. To create mixotrophic conditi...
The dependence of Redfield ratio from phase of water regime of river ecosystems
The authors compared the Redfield ratio (RR) of water in rivers Prut, Dniester and Siret in the Chernivtsi region within a phase of the lower summer and spring floods. Samples of water were taken by Rutner's batometr nea...
EFFECT OF SODIUM NITROPRUSSIDE ON ACTIVITIES OF ANTIOXIDANT AND GLUTATHIONE-RELATED ENZYMES IN LEAVES OF MAIZE SEEDLINGS
Sodium nitroprusside was used as nitric oxide (•NO) donor to investigate effects of •NO on the activity of antioxidant enzymes in leaves of maize seedlings. Seeds of maize hybrid Kharkivskyj 195 MB (Zea mays L.) were use...
АКТИВНІСТЬ ЛУЖНОЇ ФОСФАТАЗИ СЕСТОНУ НА ГІДРОФІЗИЧНОМУ ПОЛІГОНІ ТРОПІЧНОЇ ЗОНИ ТИХОГО ОКЕАНУ
Наведено результати визначення активності лужною фосфотази сестону поверхні вод північно-східної частини тропічної зони тихого океану. Результати даних досліджень необхідно для визначення екологічного фону на гідрофізичн...
Impact of combined effects of Ikva river pollution on cytogenetic homeostasis of fish fauna representatives
For the first time the author has received the data regarding the impact of hydro-chemical parameters on the formation of fish cytogenetic homeostasis in the Ikva River within the territory of Rivne Oblast, particularly...