Review of genome sampling methods in sequencing libraries preparation protocols

Journal Title: Agronomy Science - Year 2018, Vol 73, Issue 4

Abstract

Since the publication of the full sequence of the Arabidopsis thaliana genome in 2000 [AGI Initiative 2000], a period of dynamic genome exploration began. In the last decade, with the revolution in the next generation sequencing, the number of scientific reports based on sequence analysis has increased exponentially. New, fast, high throughput and relatively inexpensive nucleic acid sequencing technologies have become available and widespread, opening up the possibility of making extensive use of molecular tools in science and breeding practice. These new methods include whole genome sequencing and various methods of reduced representation sequencing. The multitude of available methods, varying in terms of availability and costs, generating different types of result data, dedicated to different research and application purposes, may make it difficult to choose the best variant [Poland et al. 2012]. The aim of this paper is to familiarize the reader with the possibilities and application of selected genotyping techniques with the use of sequencing.

Authors and Affiliations

MARTA PUCHTA, PAULINA BOLC, URSZULA PIECHOTA

Keywords

Related Articles

Wpływ nawożenia magnezem i dokarmiania dolistnego Mikrosolem U na zdrowotność i jakość korzeni żeń-szenia amerykańskiego (Panax quinquefolium L.)

W czteroletnim doświadczeniu polowym (1999–2003) zlokalizowanym na glebie piaszczystej badano wpływ wzrastających dawek nawożenia magnezem oraz dokarmiania dolistnego Mikrosolem U na obsadę roślin, porażenie przez grzyby...

Wyniki ekonomiczne i produkcyjne gospodarstw roślinnych na tle gospodarstw zwierzęcych w regionie Mazowsze i Podlasie

Celem przeprowadzonych badań było porównanie wyników ekonomicznych i produkcyjnych w grupie gospodarstw z uprawami polowymi (gospodarstwa roślinne) oraz gospodarstw zwierzęcych (średnio z trzech typów) o podobnej powierz...

Wpływ warunków pogodowych i czynników agrotechnicznych na wartość siewną nasion koniczyny białej (Trifolium repens L.)

W latach 2011–2012 przeprowadzono eksperyment laboratoryjny, w którym oceniano wartość siewną nasion koniczyny białej odmiany Barda. Oceniane nasiona pochodziły ze ścisłego doświadczenia polowego realizowanego w latach 2...

Nitrogen gross balance in farms specialised in plant production in selected regions of Poland

The aim of the performed investigations was to evaluate nitrogen management in farms specialising in plant production situated in the following voivodeships: Wielkopolskie, Dolnośląskie, Opolskie and Mazowieckie. The ana...

Zmienność plonowania i cech użytkowych odmian pszenżyta ozimego w Winnej Górze

Przeprowadzono analizę interakcji odmian pszenżyta ozimego z latami badań. Zgodnie z metodyką przyjętą dla doświadczeń porejestrowych założono metodą pasów prostopadłych (split-block) doświadczenie polowe z 10 odmianami...

Download PDF file
  • EP ID EP454194
  • DOI 10.24326/asx.2018.4.9
  • Views 55
  • Downloads 0

How To Cite

MARTA PUCHTA, PAULINA BOLC, URSZULA PIECHOTA (2018). Review of genome sampling methods in sequencing libraries preparation protocols. Agronomy Science, 73(4), 93-103. https://europub.co.uk./articles/-A-454194