Wpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR
Journal Title: Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia - Year 2012, Vol 64, Issue 2
Abstract
Introduction: Obtaining a reliable laboratory test result depends on many factors, among which preanalytical factors play a significant role. The aim of this study was to determine the effect of temperature, storage time of samples and number of freezing and thawing cycles on the results of tests carried out by PCR. Methods: The study was conducted in a model of cytomegalovirus (DNA) and with four types of clinical material: whole blood, serum, cerebrospinal fluid, urine and archival samples. After contamination with CMV clinical samples were incubated under various conditions for a specified period of time or subjected to cycles of freezing and thawing. The presence of DNA - CMV were determined by nested PCR method. Results: The results revealed that in the case of applied levels of contamination and in model used in the study: 1) CMV DNA in samples of clinical material (blood, serum, cerebrospinal fluid, urine) for testing by PCR remains stable for at least 5 days at room temperature or refrigerated and at least 7 days when frozen, 2) Repeated freezing and thawing clinical specimens has no influence on the result of the presence of viral DNA, 3) Isolated viral DNA is stable in the temperature of the freezer and can be subjected to at least 20 freeze-thaw cycles without affecting the PCR results. Conclusions: Viral DNA in clinical specimens examined in the applied experimental conditions is stable. Określono wpływ temperatury, czasu przechowywania próbek różnych materiałów klinicznych oraz liczby cykli zamrażania i rozmrażania na wyniki oznaczeń przeprowadzonych metodą PCR. Badania przeprowadzono na modelu wirusa cytomegalii (DNA).
Authors and Affiliations
Agnieszka Trzcińska, Anna Laskowska, Irena Brodzka, Joanna Siennicka
Keywords
Related Articles
- EP ID EP75357
- DOI -
- Views 116
- Downloads 0
Spektrum mikrobiologiczne oraz lekowrażliwość bakterii izolowanych od pacjentów z zakażeniem wewnątrzbrzusznym Microbiologic spectrum and susceptibility of bacteria isolated from patients with intra-abdominal infection
Zakażenia wewnątrzbrzuszne (IAIs) stanowią wyzwanie diagnostyczne i terapeutyczne. Występowanie oporności na antybiotyki stwarza ryzyko niepowodzenia terapii empirycznej. Profil wrażliwości bakterii wywołujących IAIs na...
Metody mikrobiologicznej diagnostyki zakażeń Clostridium difficile Diagnostic methods for Clostridium difficile infections
Clostridium difficile jest przyczyną 30-50% biegunek poantybiotykowych, co stanowi olbrzymie obciążenie kliniczne i ekonomiczne. U około 30% pacjentów dochodzi do nawracających zakażeń i aż u 45-65% z nich rozwijają się...
Synergizm leków przeciwgrzybiczych i olejków eterycznych wobec Candida sp., oceniany zmodyfikowaną metodą gradientowo-dyfuzyjną
Przedstawiono dwie modyfikacje standardowej metody oznaczania wrażliwości drożdżaków z rodzaju Candida na antymikotyki, z użyciem gradientowych testów paskowych (MIC Test Strip). Wykazano przydatność zaproponowanych mody...
Przydatność odczynu immunofluorescencji pośredniej z wykorzystaniem przeciwciał monoklonalnych w diagnostyce przypadków pneumocystozowego zapalenia płuc
Wykazano większą przydatność diagnostyczną metody OIF przy użyciu przeciwciał monoklonalnych do wykrywania inwazji Pneumocystis jirovecii u osób z obniżoną odpornością i śródmiąższowym zapaleniem płuc w stosunku do rutyn...
Ocena lipolitycznej aktywności szczepów Staphylococcus epidermidis i Staphylococcus haemolyticus
Oceniono lipolityczną aktywność 66 szczepów Staphylococcus epidermidis i 37 szczepów Staphylococcus haemolyticus izolowanych z krwi oraz wymazów z ran i ropy, na podłożu agarowym wzbogaconym estrem kwasu tłuszczowego: Tw...