Çoklu-İlaç Dirençli P. aeruginosa ve E.coli Suşlarında Antibiyotik Direnç Genlerinin ve Sınıf 1 İntegron Gen Kasetlerinin Araştırılması
Journal Title: Cumhuriyet Science journal - Year 2018, Vol 39, Issue 4
Abstract
P. aeruginosa ve E.coli izolatlarının birçok antibiyotiğe direnç kazanması nedeniyle bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi zorlaşmıştır. Bundan dolayı klinik izolatlarda antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı çoklu-ilaç dirençli P. aeruginosa ve E.coli klinik suşlarında beta laktamaz direnç genlerinin ve sınıf 1 integronlar gen kasetlerinin varlığının araştırılmasıdır. Gümüşhane Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan, idrar ve balgam örneklerinden izole edilen 2 P. aeruginosa ve 2 E.coli izolatlarının tanımlaması ve antibiyogramı Vitek 2 Compact otomatize sistemi ile çalışılmıştır. Total DNA izolasyonu kaynatma DNA metoduyla yapılmıştır. blaVIM, blaNDM, blaIMP, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-40, blaKPC ve sınıf 1 integron gen kasetlerine ait primerler kullanılarak PZR’ler gerçekleştirilmiştir. Amplikasyonun gerçekleştiği tüm örnekler %1’lik agaroz jelde yürütülmüştür ve daha sonra UV ışığında görünür hale getirilmiştir. Antibiyogram sonucuna göre P. aeruginosa izolatları gentamisin hariç kullanılan tüm antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. E.coli izolatlarının ise karbapenemlere karşı duyarlı sefalosporin grubu antibiyotiklere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Sınıf A beta laktamaz genlerinden blaCTXM-1 4 suşun 3’ünde bulunurken, hiçbir suşta blaCTXM-2, blaKPC ve blaGES genleri tespit edilmemiştir. Araştırılan sınıf B ve sınıf D beta laktamaz genlerinin varlığı hiçbir örnekte görülmemiştir. 3 suşta sınıf 1 integronun varlığı tespit edilmiştir. DNA dizi analiz sonucuna göre üç integron pozitif örneğin dfrA17/AadA5 gen kasetine sahip olduğu belirlenmiştir.
Authors and Affiliations
Azer ÖZAD DÜZGÜN, Ayşegül SARAL
Keywords
Related Articles
- EP ID EP488414
- DOI 10.17776/csj.409136
- Views 197
- Downloads 0
Thermoluminescence Properties of Quartzite Rock after β-irradiation
In the present study, the thermoluminescence characteristics of natural quartzite collected from Karaisalı (Adana) in Turkey were investigated after β irradiation at room temperature with the purpose to use as radiation...
The Comparison of Primary, Secondary and Tertiary Amine Ligands on Palladium (II) Complex Ion on Thermo-Physical, Chemical Reactivity, and Biological Properties: A DFT Study
The Palladium is considered as the catalyst for coupling reaction and useful metal in industry. The thermo-physical, chemical reactivity and biological interaction are considered the most expected parameters for use in a...
Evaluation of Kinetic Effects of Baicalein in Different Breast Cancer Cell Lines
The aim of this study was to compare the antiproliferative effects of baicalein which is a flavonoide on MCF-7 and MDA-MB-231 cell line. The experiments were carried out with the evaluation of the parameters. Including c...
Consistent Empirical Physical Formula Construction for Gamma Ray Angular Distribution Coefficients by Layered Feedforward Neural Network
Multipolarities of gamma rays and spins-parities of nuclear states are usually investigated by the angular distribution of gamma rays emitted from aligned states formed by nuclear reactions. For different multipolarities...
Experimental Investigation of MR Effect to RTV Silicone Rubber-based Magneto-rheological Materials
Magneto-rheological Elastomers are smart materials whose properties can be altered reversibly and almost instantaneously by application of external magnetic fields. Silicone rubber species are used widely in the laborato...