Çoklu-İlaç Dirençli P. aeruginosa ve E.coli Suşlarında Antibiyotik Direnç Genlerinin ve Sınıf 1 İntegron Gen Kasetlerinin Araştırılması
Journal Title: Cumhuriyet Science journal - Year 2018, Vol 39, Issue 4
Abstract
P. aeruginosa ve E.coli izolatlarının birçok antibiyotiğe direnç kazanması nedeniyle bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi zorlaşmıştır. Bundan dolayı klinik izolatlarda antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı çoklu-ilaç dirençli P. aeruginosa ve E.coli klinik suşlarında beta laktamaz direnç genlerinin ve sınıf 1 integronlar gen kasetlerinin varlığının araştırılmasıdır. Gümüşhane Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan, idrar ve balgam örneklerinden izole edilen 2 P. aeruginosa ve 2 E.coli izolatlarının tanımlaması ve antibiyogramı Vitek 2 Compact otomatize sistemi ile çalışılmıştır. Total DNA izolasyonu kaynatma DNA metoduyla yapılmıştır. blaVIM, blaNDM, blaIMP, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-40, blaKPC ve sınıf 1 integron gen kasetlerine ait primerler kullanılarak PZR’ler gerçekleştirilmiştir. Amplikasyonun gerçekleştiği tüm örnekler %1’lik agaroz jelde yürütülmüştür ve daha sonra UV ışığında görünür hale getirilmiştir. Antibiyogram sonucuna göre P. aeruginosa izolatları gentamisin hariç kullanılan tüm antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. E.coli izolatlarının ise karbapenemlere karşı duyarlı sefalosporin grubu antibiyotiklere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Sınıf A beta laktamaz genlerinden blaCTXM-1 4 suşun 3’ünde bulunurken, hiçbir suşta blaCTXM-2, blaKPC ve blaGES genleri tespit edilmemiştir. Araştırılan sınıf B ve sınıf D beta laktamaz genlerinin varlığı hiçbir örnekte görülmemiştir. 3 suşta sınıf 1 integronun varlığı tespit edilmiştir. DNA dizi analiz sonucuna göre üç integron pozitif örneğin dfrA17/AadA5 gen kasetine sahip olduğu belirlenmiştir.
Authors and Affiliations
Azer ÖZAD DÜZGÜN, Ayşegül SARAL
Keywords
Related Articles
- EP ID EP488414
- DOI 10.17776/csj.409136
- Views 190
- Downloads 0
Investigation of Antibacterial Properties of Mucus and Coelomic Fluid Obtained from Eisenia Fetida
In several researches it was found that earthworms are protected from the infective effects of many pathogen microorganisms, with which they live together, by their strong immune systems and secreted fluids; in addition,...
Investigation of Antitumor and Antibacterial Properties of Some New Thiophene-2,5-Dicarboxylic Acid bis-aryl (alkyl) amide Compounds
Thiophene-derived compounds are of interest in chemistry, biology and pharmacology because of their various pharmacological activities This study aims to investigate the antitumor and antibacterial activity of thiophene-...
A Fuzzy Logic Application for Explain Relationships Between 222Rn Concentration and Earthquakes
Earthquake behaviors are, in general, among the non-linear topics of physics. Unfortunately researches up to now could not yet propose a complete mathematical model for earthquake behavior prediction possibilities. The m...
Determination of Outdoor Absorbed Gamma Dose Rates of Kahramanmaraş Province, Turkey
Outdoor absorbed gamma dose rates were measured in 118 different regions at a height of 1 m above the ground in the gonad (genitals) level in humans in Kahramanmaraş province and its vicinity using Eberline portable dete...
AES Encryption and A Cryptosystem Obtained with Soft Set II
In this paper, a new cryptographic algorithm was created with the soft sets, symmetric groups, soft matrices representing soft sets, and AES. In 1999, by Molodtsov proposed soft set theory as a new mathematical tool to d...